Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smndc1Q8BGT7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smndc1Q8BGT7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smndc1Q8BGT7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smndc1Q8BGT7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smndc1Q8BGT7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smndc1Q8BGT7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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