Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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