Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubp1Q811S7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubp1Q811S7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubp1Q811S7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubp1Q811S7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubp1Q811S7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ubp1Q811S7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ubp1Q811S7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubp1Q811S7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubp1Q811S7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubp1Q811S7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubp1Q811S7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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