Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms