Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ChfrQ810L3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms