Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms