Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms