Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh8Q80Y20 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms