Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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