Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf8Q80TJ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms