Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Clec18aQ7TSQ1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clec18aQ7TSQ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clec18aQ7TSQ1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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