Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dsg1bQ7TSF1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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