Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms