Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek5Q7TSC3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek5Q7TSC3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms