Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stk40Q7TNL3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms