Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stambpl1Q76N33 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms