Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme8Q715T0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms