Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynmQ70IV5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms