Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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