Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms