Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms