Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms