Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx13Q6PHS6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms