Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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