Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms