Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trak1Q6PD31 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms