Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Zbtb40Q6PCS8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms