Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms