Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms