Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc148Q6P5U8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc148Q6P5U8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms