Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam222bQ6P539 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam222bQ6P539 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms