Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms