Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms