Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms