Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms