Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NipblQ6KCD5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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NipblQ6KCD5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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