Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms