Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil1Q6EDY6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms