Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9bQ6EBV9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms