Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf8Q6DID3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms