Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms