Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms