Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms