Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ric1Q69ZJ7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms