Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80dQ66JY2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms