Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms