Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CochQ62507 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CochQ62507 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CochQ62507 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CochQ62507 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CochQ62507 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms