Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms