Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms