Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Taf6Q62311 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Taf6Q62311 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Taf6Q62311 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf6Q62311 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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